Do zadań Rady Naukowej należy m.in.:

1. uchwalanie statutu;
2. opiniowanie kandydatów na stanowiska: zastępcy dyrektora do spraw naukowych, sekretarza naukowego oraz kierowników komórek organizacyjnych;
3. opiniowanie kierunkowych planów tematycznych badań naukowych i prac rozwojowych oraz finansowych instytutu;
4. zatwierdzanie perspektywicznych kierunków działalności naukowej, rozwojowej i wdrożeniowej;
5. opiniowanie wniosków o przekształcenia, podziały i reorganizacje instytutu;
6. opiniowanie regulaminu organizacyjnego i planu finansowego;
7. opiniowanie rocznych sprawozdań finansowych i z wykonania zadań;
8. opiniowanie kwalifikacji naukowych oraz oceny dorobku naukowego;
9. opiniowanie wniosków o przyznanie stypendiów naukowych;
10. prowadzenie przewodów doktorskich i habilitacyjnych oraz opiniowanie wniosków o tytuł profesora;
11. opiniowanie programów kształcenia oraz przebiegu doktoratów;
12. opiniowanie regulaminów z zakresu praw autorskich i komercjalizacji wyników;

Zgodnie z wymaganiami Ustawy o Instytutach Badawczych w skład nowej Rady Naukowej Narodowego Instytutu Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie — Państwowego Instytutu Badawczego wchodzi 20 przedstawicieli Instytutu, wybieranych w głosowaniu tajnym, na okres 4 lat.